¿Cuáles son las desventajas de CRISPR?

La primera de las limitaciones de las herramientas CRISPR es la posibilidad de cortar en otras secuencias de ADN, parecidas a las que tenemos intención de editar, pero no idénticas, que están en otro lugar del genoma. Hay dos grandes grupos de riesgos o limitaciones que se deben tener en cuenta al utilizar las herramientas CRISPR de edición genética. En primer lugar la posibilidad de que la guía de ARN se aparee imperfectamente en otro lugar del genoma, con otra secuencia de ADN muy parecida pero no exactamente idéntica. Y que esa unión se mantenga el tiempo suficiente para que la nucleasa Cas9 reconozca a la guía sobre el ADN y proceda a cortar en ese otro lugar adicional del genoma, lo cual genera una oportunidad de edición extra, no controlada, además de la prevista. Esta relativa falta de especificidad es una ventaja para las bacterias pero representa un problema cuando se intenta usar esta herramientas CRISPR para editar genéticamente un locus y solamente ese locus. La segunda de las limitaciones de las herramientas CRISPR tiene que ver con lo que ocurre tras el corte, que puede repararse de diversas maneras, incluyendo la secuencia prevista, pero también otras imprevistas que no queremos ni necesitamos. Si al sistema le añadimos una molécula de ADN monocatenario con secuencias complementarias a derecha y a izquierda del corte entonces esta secuencia se usará como molde, y promoverá la aparición de los cambios que estuvieran incluidos en el molde. Ahora bien, no podremos evitar que los sistemas de reparación, que no tienen la precisión de las herramientas CRISPR, cometan errores, al azar, y resuelvan el corte de ADN de doble cadena de diversas maneras, a veces insertando y añadiendo letras, o a veces eliminándolas, o las dos cosas a la vez. Esta variabilidad en los resultados, esta incertidumbre, es fundamental en cualquier experimento CRISPR.